学院实行理事会领导下的院长负责制，理事会是学院最高决策机构，负责统筹协调资源，对学院建设发展的重大事项进行审议、决策。理事会采取“一校加多企”的形式组建，由理事长单位、副理事长单位和理事单位组成，学校为理事长单位，若干专项联合培养单位和区域重点企业作为副理事长单位和理事单位。理事会下设秘书处，作为理事会的常设办事机构，挂靠在学院。

理事会成员单位：

合肥国家实验室是全国首个获批组建的新型国家实验室，其主创科研团队主要来自于我，聚焦量子信息、量子计算和量子精密测量三大量子科技前沿研究方向，与我校在电子信息专业学位类别开展工程硕博士联合培养。现有高级职称的科研人员560余人，连同从事基础研究、技术开发、工程应用的其他各类科研人员共计1800余人。该单位创建之初即与我校开展人才联合培养，现已形成较为稳定持续的联合培养机制，我校工程类研究生深度参与到“墨子号”卫星、“量子京沪干线”等重要量子工程科技项目之中。

中国石油天然气集团有限公司是国有重要骨干企业和全球主要的油气生产商和供应商之一，与我校在能源动力、材料与化工等专业学位类别开展工程硕博士培养改革专项联合培养，经校企多次会商，健全完善“企业出题、导师解题、学生答题”的联合培养合作机制，企业发布技术攻关需求清单，按照联合培养1个工程硕士50万元/项目、联合培养1个工程博士80万元/项目进行立项，校企导师联合揭榜申报科研项目，现已完成首批联合培养工程硕博士联合科研攻关项目立项和论证工作。

中国电子科技集团有限公司是中央直接管理的国有重要骨干企业，是我国军工电子主力军、网信事业国家队、国家战略科技力量，与我校在电子信息、材料与化工等专业学位类别开展工程硕博士培养改革专项联合培养。2018年，该单位即与我校签署战略合作协议，近年来，双方联合承担国家“科技创新2030—重大项目”之天地一体化信息网络工程项目，共同参与建设天地一体化网络合肥中心，依托重大工程项目开展联合科研攻关和人才培养。

中国广核集团有限公司是由国务院国有资产监督管理委员会控股的中央企业，业务覆盖核能、核燃料、新能源、非动力核技术、数字化、科技型环保、产业金融等领域，拥有2个内地上市平台及3个香港上市平台，与我校在材料与化工、能源动力等专业学位类别开展工程硕博士培养改革专项联合培养。学校与该单位长期保持良好合作，2023年，该单位与我校科教融合单位中科院合肥物质科学研究院围绕“第四代核电站关键技术研发”进行科研项目，项目经费约为1.09亿元，学校根据项目情况分配研究生指标，部分学生可以深度参与项目研发工作。

中国稀土集团有限公司是国务院国有资产监督管理委员会直接监管的股权多元化中央企业，主要从事稀土资源开发、冶炼分离、精深加工以及稀土产品进出口贸易等业务，与我校在材料与化工、资源与环境等专业学位类别开展工程硕博士培养改革专项联合培养。2023年，中科大、中科院赣江创新研究院、赣州市人民政府与该单位联合签署四方合作协议，围绕稀土新材料研究和产业人才培养进行深度合作，是我校新材料领域的重点合作企业。

中国兵器工业集团有限公司是中央直接管理的特大型国有重要骨干企业，是国家战略科技力量的重要组成部分，是国家安全和国防建设的主力军，旗下拥有数十家科研研究院所和十余家上市公司，与我校在能源动力、材料与化工等专业学位类别开展工程硕博士培养改革专项联合培养，是我校重要的研究生专业实践基地和毕业生优质就业单位。

龙芯中科技术股份有限公司是国产自主研发计算机处理器的行业龙头企业，主要从事国产通用处理器的设计和研发，并在此基础上进行国产基础软硬件生态体系的构建和发展。依托中国科学院计算技术研究所，着力为国家战略需求提供自主、安全、可靠的处理器，为信息产业的创新发展提供高性能、低成本的处理器和基础软硬件解决方案。该单位与我校已连续四年开展“订单式”联合培养，与我校先进技术研究院合作共建“龙芯班”，每年联合招生40人左右，采取工学交替培养模式，学生在校修读完规定学分之后赴企进行专业实践，深度参与到企业项目中，毕业之后可优先留企工作，也可自主选择其他就业单位。

科大讯飞股份有限公司是亚太地区知名的智能语音和人工智能上市企业，长期从事智能语音、自然语言理解、计算机视觉等核心技术研究并保持了国际前沿技术水平，是我校工程类专业学位研究生优质专业实践基地。早在2011年，该单位即与学校共建语音及语言信息处理国家工程研究中心（国家级工程研究中心），2021年升级为国家工程实验室。该单位与学校建立了运行良好的“旋转门”制度，部分校内导师到企参与重大工程项目，部分企业技术专家到校担任工程硕博士导师，形成了长期稳定持续的校企联合科研和人才培养机制。